O Programa de Pós-Graduação em Educação Escolar, Mestrado e Doutorado Profissional (PPGEEProf) prima pela gestão participativa e colaborativa. Com isso, tem discutido e buscado potencializar a participação qualitativa de todos os docentes e parte representativa dos discentes, e possibilitar que estes se integrem e se comprometam, responsabilizando-se pelo seu bom funcionamento. Assim, a gestão do PPGEEProf é realizada:
Em nível administrativo e deliberativo:
Coordenação
Colegiado
Corpo de Docentes
Comissões de Trabalho
Em nível financeiro:
Núcleo de Ciências Humanas e Propesq/UNIR
Parcerias
Grupos de Pesquisa a partir de projetos financiados